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最近，该所吴秀杰副研究员等经过详细研究，发现新石器时代长江以南的居民表现为宽的鼻部和较矮的上面部，秦岭以北的居民表现为较高的上面部和较高的眶部，而位于秦岭和长江之间的人群其体质特征比较复杂，有些特征倾向于北方类型、而有些特征倾向于南方类型。
现代居民，相比于长江以南的居民，秦岭以北的居民表现为更宽阔的面部和高的鼻部。通过对新石器时代、现代34处考古遗址出土的309例人类遗骸的个体分布，并结合动物群、植物生态学、血液学、遗传学及语系的研究结果，吴秀杰等提出秦岭和长江为我国古代居民体质特征差异的分水岭，这种体质特征的差异主要是由于长期适应环境因素造成的。这种差异向上可以追溯到距今60万年左右的周口店直立人和南京汤山直立人。
多年来，我国研究古代居民的体质特征时，采用的方法基本是选用一些主要的颅骨测量数据，通过其平均值的分析得出结论。
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