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(1)作为分解者参与物质循环。即把动植物遗体分解成二氧化碳、水和无机盐，被植物重新吸收利用，制造有机物。故对于自然界中二氧化碳等物质的循环起重要作用
(2)引起动植物和人患病。这类微生物多营寄生生活，从活的动植物体上吸收营养物质。如链球菌引起扁桃体炎，真菌引起癣、小麦叶锈病(注意：脚气和细、真菌没关系(是缺维生素B导致的)
(3)与动植物共生。共生指一种生物与另一种生物共同生活在一起，相互依赖、彼此有利的现象，简言之，互利共生。(1)如真菌与藻类共生形成地衣(2)根瘤菌与豆科植物，(3)与动物：兔、牛、羊内有些细菌帮助分解纤维素
(4)与人：人的肠道中有一些细菌能制造维生素B12和维生素K对身体有益
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