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①作为分解者参与物质循环。即把动植物遗体分解成二氧化碳、水和无机盐，被植物重新吸收利用，制造有机物。故对于自然界中二氧化碳等物质的循环起重要作用 。
②引起动植物和人患病。这类微生物多营寄生生活，从活的动植物体上吸收营养物质。如链球菌引起扁桃体炎，真菌引起癣、小麦叶锈病 。注意：脚气和细、真菌没关系(是缺维生素B1导致的)
③与动植物共生。共生指一种生物与另一种生物共同生活在一起，相互依赖、不能分开的现象，简言之，互利共生。如真菌与藻类共生形成地衣
④再如：根瘤菌与豆科植物，根瘤菌将空气中的氮转化为植物能够吸收的含氮物质，从而使土壤中氮元素含量增高，增加土壤肥力，提高农作物产量(氮是植物生活中需要量较大的物质)。
与动物共生：兔、牛、羊内有些细菌帮助分解维生素
与人共生：人的肠道中有一些细菌能制造维生素B12和维生素K对身体有益
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