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上海市计划生育科学研究所生殖免疫学课题组和复旦大学生命科学院基因功能课题组合作，用先前自主建立的肽生物合成方法，解码了致癌性人乳头瘤病毒58型（HPV58）所编码三个不同长度关键蛋白的精确表位组，并展现了相关组学研究的可行性和意义，包括总体框架及其内容。相关研究成果发表于《科学报告》。
作为合成肽疫苗和肽诊断抗原研制的基础，对疾病相关抗原和病毒关键编码蛋白的抗原性表位扫描作图，一直是免疫学和病毒学领域内一个重要的研究目标。但是，以往建立不下数百种的表位鉴定方法，都无法用兔和鼠类多克隆抗血清（多抗）鉴定其所识别较长抗原性肽的最小表位基序，因而无法知晓在用化学合成肽法的表位作图中常出现很多相邻阳性抗原性肽之间存在的表位数，以致不能揭示靶抗原的完整表位组，乃至开展其组学研究。
据悉，该项成果主要包括：1）由于对各表位最小基序的精细鉴定，不仅发现了E6、E7和L1三个蛋白上总共30个表位，而且据此通过同源蛋白序列比对，一次性确定了它们各自的保守性和特异性，尤其发现了L1的三个‘广谱性’表位，为今后研制‘通用’预防性HPV多表位肽疫苗提供了进一步依据和候选表位；2）致癌性HPV型分类从无客观明确标准，一直是依据临床流行病学调查和HPV系统进化树分析结果，因此发现的仅存在于高危型HPV中的一个E6-2表位，将可用作HPV致癌风险性分类的第一个参照标志物；3）通过生物信息学分析和用鼠抗HPV58-L1假病毒颗粒血清验证，确定了L1表位组中各表位的抗体可及性和潜在的保护性表位，也提示了不同物种对特定抗原免疫应答的相似性和差异性。
专家表示，如同人类基因组解码有助于发现功能基因一样，靶蛋白表位组的解码，显然也为高效率发现抗体中和性/保护性表位以及广谱性和特异性表位奠定了基础，进而促进今后临床有效的相关重组多表位肽疫苗和/或检测抗原的研发。
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