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孟山都在印度的业务可能受到来自印度一家政府机构研发出的产品的极大挑战。位于印度Nagpur的棉花研究中心（CICR）推出了21个含有Bt基因的棉花种子品种。科学家表示其售价可能只有杂交种子的10%，并且具有更好的抗虫害能力。
这些Bt品种今年将提供给Telangana和Maharashtra邦的农业部门，在多个地点由各邦的农业大学开展试验研究。2016年在多地开展的大田试验结果将筛选出最优的Bt品种，并将于2017年提供给种植者。
CICR的总监KRKranthi表示，“在印度农业部确认14年前由孟山都引入的转基因Bt棉花（Bollgard-mon531）没有专利问题后，我们现在将Bt基因植入传统的印度棉花品种上。”
一名来自新德里的印度农业研究委员会的科学家表示：“我期望通过较低的生产成本，可以使这些Bt品种获得较高的产能，尤其是在Maharashtra和Telangana等雨浇农业区。”
他表示大部分品种都是150-180天的短周期作物，因为这样可以躲避之后的雨季压力干旱压力，而这本来正是关键的开花期和成铃阶段。“短周期品种最适合雨浇条件下获得高产能。”
农业部对该项目密切关注，以保护种植者的利益。Bt品种的售价可能在每千克150-200卢比，并且可以重复种植，相比较而言，Bt棉花杂交品种的售价在2000卢比每千克，而且只可以使用一次。
一位CICR的科学家表示，不像市场上大多数Bt杂交品种对刺吸式害虫和疾病较为敏感，而几乎所有的非Bt棉花品种具有天然抗性。“我们将这些性状与Bt基因进行聚合育种，可以提供广谱抗性。”
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